Пропали файлы с жесткого диска

Всех приветствую!

Хочу обратиться за советом.
Ситуация следующая:
Как-то раз, утром, придя на работу, включил комп и обнаружил, что пропала целая папка (довольно объемная) с нужными мне по работе файлами. Думал, что может случайно переместил её мышой куда-нибудь - искал, перерыл весь диск, не нашел. Папка просто исчезла. Думал - мож кто включал комп в моё отсутствие. Вариант отпал за несостоятельностью, потому что не нашел я того, кому могло понадобиться удаление именно этой папки.
Второй раз уже дома переустанавливал я винду. Отформатил С:/, поставил на него систему, дрова, проги. Всё готово. Захожу на F:/ - диск с файлами. Из корневого исчезли все файлы, которые там были до переустановки системы. В том числе архив со шрифтами. Файлы не особо важные, но всё же...
В обоих случаях файлы пропадали с логических не системных разделов.

Не то, чтобы острая проблема встала, просто сталкивался с этим два раза, не хотелось бы столкнуться снова.

Какая файловая система?

Fat 32 на обоих компьютерах.

Конвертируйте, по возможности, в NTFS.

Файлы сами не удаляются, их или удалил антивирус, или вирус, или человек. Если удалила система в силу рассыпания файловой системы, то поищите их в Lost&Found.

Что такое Lost&Found? И как файловая система может рассыпаться? А еще может быть мне кто-нибудь раз и навсегда объяснит в чём преимущество NTFS над FAT?
Я не мастдайный ламер, но и не супер прошаренный, поэтому многих вещей не понимаю. Само собой, что сами файлы удалиться не могут. Должна быть причина. Факт в том, что до переустановки файли были. Антивирусник не вякал. Форматил я С:/. А когда все поставил... тю-тю. Возможно ли, что при формате одного раздела каким-то образом частично зацепился другой? Жесткий-то всё-таки один... На работе с коллегой нашли программку, что-то типа Easy Recovery, не помню как называлась. В итоге файлы потеряные мы нашли и восстановили, но открыть их уже не смогли.